follow dev3, 1. 为根目录及 custom、data、static/js、tools 和导师离线页补充目录级 AGENTS.md 约定; 2. 完善 .gitignore，覆盖通用临时、构建、语言、科学数据、凭据及 agent 运行时产物并保留参考资料例外; 3. 精简 README.md，保留站点链接; [codex].
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